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Pepsin 3D Modell
Hier wird die des Proteins schematisch dargestellt. alpha-Helices sind als rote Schrauben, beta-Faltblätter als gelbe Pfeile, Zufallsknäuel grün und beta-Turns blau angezeigt.
Drei (gelb) stabilisieren das Molekül.
Die des Enzyms befindet sich am Grund einer tiefen Spalte, die das Molekül durchzieht. Die katalytischen Aspartat-Reste sind rot (Asp 32 ) und orange (Asp 215) markiert.
In der der Atome wird sichtbar, wie eng die Spalte ist, in die das Substrat binden muss. Es verwundert daher nicht, dass denaturierte Proteine deutlich leichter gespalten werden als native, die mit ihrer kompakten Faltung nicht zur aktiven Stelle gelangen können.
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